OixCloudSTRUCTURE DATA
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蛋白质相互作用界面与热点残基可视化

OIXCLOUD / STRUCTURAL DATA PLATFORM

把结构数据交给清晰的任务流程

OixCloud提供官网登录入口说明、客户端下载安装指引与多设备数据协作服务,围绕PDB结构文件、蛋白质相互作用、热点残基、AI模型和科研任务版本整理实用资料。
PDB结构文件与链编号
INTERFACE复合物接触与热点
MODEL验证集与错误边界
RECORD版本、参数与结果

一次任务怎样保持完整

从结构输入,到可以复核的结果

结构准备

先检查复合物与链

PDB编号相同,不代表文件状态完全一致。来源、链、残基缺失和配体处理要先写清楚。

界面定义

说明邻域如何形成

固定距离和Voronoi邻域观察的是不同空间关系,阈值必须与研究问题一起保存。

模型运行

把分数放回验证集

热点属于少数类。准确率、召回率与独立测试集共同决定模型能支持什么判断。

结果交接

记录版本与失败条件

客户端、模型、输入、参数和输出目录要保持关联,设备变化后才能继续工作。

INTERFACE FIELD

热点不在蛋白质表面的每一个位置

少数界面残基可能承担显著的结合自由能贡献。OixCloud把结构环境、预测证据和实验边界并排呈现,帮助使用者理解分数,而不是只寻找红色标记。

打开界面图谱
protein Aprotein B

STRUCTURE LOG

结构文件进入平台前的记录方式

检查项目为什么重要保留内容
结构来源区分实验结构与模型结构PDB编号、日期、方法
链与复合物决定相互作用界面链标识、生物学组装
残基状态影响邻域和能量特征缺失、突变、替代构象
任务版本解释不同运行结果客户端、模型、参数
阅读结构数据说明

OIXCLOUD RESEARCH EDITION

结构计算,不只是一串预测分数

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关于历史研究资料

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